Studi Sains Hayati

Pendahuluan

Secara ringkas ilmu hayat/biologi didefinisikan sebagai  ilmu yang mempelajari kehidupan organisme hidup (tumbuhan dan hewan termasuk manusia). Ilmu hayat atau ilmu kehidupan meliputi studi tentang sifat-sifat, klasifikasi dan tingkah laku organisme, bagaimana spesies terlahir dan bagaimana mereka saling berinteraksi dengan lingkungannya, tingkah laku sosial diantara komunitas dan sebagainya.

 Dilihat dari sifatnya, ilmu hayat adalah sekumpulan hasil observasi fenomena yang terkait dengan kondisi hidup, hipotesis-hipotesis dan teori-teori mengenai sistem dan kondisi hidup. Arti hidup atau kondisi hidup adalah kondisi yang membedakan antara hewan dan tumbuhan dengan objek anorganik dan organisme yang mati. Artinya tumbuhan dan hewan yang hidup adalah zat organik hidup yang berbeda dengan zat organik hewan dan tumbuhan yang mati.

Keadaan hidup atau hidup yang dipelajari adalah apa-apa dan kondisi dari tumbuhan dan hewan ketika hewan dan tumbuhan tersebut dalam keadaan tidak mati.  Ciri-ciri hidup meliputi terjadinya pertukaran dan perputaran zat, perkembangbiakan, pertumbuhan dan perkembangan, respons terhadap stumulus, dan pergerakan.             Kajian terhadap ciri-ciri hidup tersebut akan mengarahkan kepada pemahaman apa yang dimaksud dengan hidup menurut ilmu hayat/biologi.

2. Ilmu Hayat

Pada tataran organisme, ilmu hayat menjelaskan fenomena proses kelahiran, pertumbuhan, proses penuaan, proses kematian dan membusuknya organisme. Selanjutnya dikaji juga tentang kesamaan sifat-sifat di antara anak (filial) dengan tetuanya (induk, parent), dan proses pembungaan tumbuhan. Fenomena lainnya meliputi laktasi penyusuan anak, metamorfosis, penetasan telur, proses penyembuhan dan juga dilengkapi dengan sifat-sifat tropisme. Pada skala yang lebih luas, ilmu hayat juga menelaah domestikasi binatang dan tanaman, juga menelaah keanekaragaman organisme binatang dan tumbuhan (Biodiversitas), perubahan (evolusi) dan kepunahan.

            Objek kajian hayati/biologis meliputi klasifikasi dan sistematik, morfologi atau struktur, fisiologi atau operasional hidup, anatomi dan sitologi atau struktur mikroskopik, proses yang khas seperti pertumbuhan dan aspek metabolisme serta kajian aspek aplikasi hayati/biologi seperti rekayasa genetika, transgenik/cloning, kultur jaringan, breeding, hibridisasi dan rekayasa hayati lainnya.

            Apabila definisi dan objek kajian hayati hanya yang bersifat wujud empiris rasional saja, maka kajian tersebut bersifat sekuler (menyisihkan  wujud yang  dimaksud pengetahuan dalam islam) karena objek kajian biologis atau sains yang diisyaratkan atau diberitakan (diperintahkan untuk diperhatikan/dilihat/dipikirkan) oleh wahyu bukan hanya materi alam yang wujudnya tampak (‘alam al-syahadah) tetapi juga alam yang tidak tampak (‘alam al-ghayb). Sebagai sains yang dipandu wahyu, memandang sains islam bersifat holistik dengan tauhid sebagai paradigma makro.  Iman dan rasio berpadu dalam sains Islam.

Struktur ilmu hayat/biologi meliputi sub bidang :

1. Botani : ilmu yang membahas dan menelaah tentang tumbuh-tumbuhan.

2. Zoologi : ilmu yang membahas dan menelaah tentang binatang.

3. Antropologi fisik : mempelajari kelahiran primata, perkembangan manusia (Evolusi “ilmu sekuler barat”), forensik dan genetika populasi. (Antropologi budaya dipelajari pada sains sosial)

Struktur ilmu hayat ditinjau dari sub disiplin meliputi :

A.  Berdasarkan dimensi/ukuran /skala wujud objek telaahan meliputi :

      1.       a. Biologi molekuler : mempelajari struktur/ sifat molekul organisme

                b. Genetika molekuler dan,

                c. Biokimia

2. Biologi Sel : mempelajari sel.

      3. Fisiologi, Anatomi dan Histologi : mempelajari objek yang besar (multiseluler)

B.  Berdasarkan jenis bidang kajian meliputi.

1. Biologi perkembangan (Embriologi) : mempelajari perkembangan/pertumbuhan

    organisme individu /ontogeni)

2. Genetika : mempelajari sifat-sifat keturunan yang diturunkan dari tetua kepada    

    keturunannya.

3. Etologi : menelaah tingkah laku kelompok-kelompok organisme

4. Sistematika : mempelajari hubungan tingkatan spesies.

5. Ekologi : mempelajari saling ketergantungan antara populasi dan lingkungan

    hidupnya.

6. Astrologi/Xenobiologi : mempelajari kemungkinan kehidupan yang ada di luar bumi.

3. Penciptaan Yang Sempurna dan Seimbang

Wahyu Allah dalam surat al-A’laa ayat 1: dapat dijadikan  salah satu ayat landasan tauhid yang munasabah dengan pemikiran tentang sains makhluk ciptaan Allah.

ﻰﻟﻋﻷﺍ ﻚﺑﺭ ﻡﺴﺍ ﺢﺒﺴ

“Ucapkan kesucian atas nama tuhan engkau yang maha tinggi.

Tafsir Al-Azhar menjelaskan “maha tinggi berarti yang maha tunggal” tidak ada yang lebih tinggi yang menjadi sekutu bagi Allah. 

Ayat kedua : “Yang telah menciptakan, lalu membentuk dengan  seimbang”.

Observasi empiris dan rasional terhadap fenomena alam membuktikan demikian seimbang dan harmonisnya kondisi wujud organisme di alam ini.: Terwujud kondisi ekuilibrium/keseimbangan “balance of nature” di alam ini. Telaah terhadap  organ tubuh hewan, keseimbangan alam dan kehidupan tumbuhan,  sampai keseimbangan komponen gas yang ada di atmosfir.

 Al-Qur’an surat Yasin ayat 80  memberikan isyarat/panduan akan terbentuknya energi zat organik (karbohidrat) dan energi gas pembakar (oksigen: gas O₂).   Gas sumber kehidupan biologis hewan dan tumbuhan di udara yaitu gas O₂ dan karbon dioksida (CO₂) selamanya dikendalikan oleh mekanisme biologis tumbuh-tumbuhan dan hewan.. 

Tumbuhan memerlukan/menyerap gas CO₂ sebagai bahan baku dalam proses fotosintesis dan mengeluarkan/dihasilkan gas oksigen (O₂) dalam proses penyusunan tersebut. Allah menciptakan manusia dengan aktivitasnya aktivitas dan gerak fisiknya  bergantung pada suplai energi nutrisi dari makanan dan suplai oksigen dari aktivitas bernafas.  Pada saat menarik nafas, dimasukkan oksigen, dan pada saat mengeluarkan nafas, dikeluarkan gas CO_2­,  Demikian juga, aktivitas kehidupan manusia yang banyak mengemisi/mengeluarkan gas racun.  Gas CO₂  adalah zat yang bersifat racun bagi hewan dan manusia, tetapi tumbuhan justru memerlukan CO₂ tersebut untuk bahan baku proses fotosintesis.  

Tidak ada yang percuma apa yang diciptakan Allah. (...ﻼﻃﺎﺒ ﺍﺫﻫ ﺕﻗﻠﺧ ﺎﻣ ﺎﻧﺒﺮ...)

Quraish Shihab dalam Rustam Effendi (2003:71) menyebutkan bahwa  ada sekitar 750 ayat al-Quran yang memberitakan alam semesta dan fenomenanya yang memerintahkan manusia untuk mengetahui dan memanfaatkannya.  Sebagaimana  Al-Qur’an surat al-Baqarah ayat 29 “ ﺎﻌﻴﻤﺠ ﺽﺭﻷﺍ ﻰﻔ ﺎﻣ ﻢﻜﻟ ﻖﻟﺧ ﻯﺫﻟﺍ ﻮﻫ”.

4.  Nilai Islami dalam Ilmu Hayat

            Naquib Al-Attas dalam Adi Setia (2005 : 54) menyebutkan ilmu yang datang dari Allah diperoleh melalui cara atau saluran:

1.   Pancaindera (sound senses/hawass salimah) yang meliputi  pancaindera eksternal (peraba, perasa, pencium, pendengaran dan penglihatan) dan pancaindera internal (common sense, representation, estimation, recollection/retention dan imagination)

2.   Khabar yang benar (khabar shadiq) berdasarkan autoritas (naql) yang meliputi : otoritas multak (otoritas ketuhanan (al-Qur’an) dan kenabian (hadist rosulullah saw.); otoritas nisbi (kesepakatan alim ulama/tawatur dan khabar orang terpercaya secara umum.

3.   Intelek (intellect/’aql) yang meliputi: ‘akal sehat /sound reason dan ilham/intuition/hads/wildan.

            Akal merupakan faktor utama dalam proses mendapatkan ilmu. Faktor akal ini yang membedakan manusia dari hewan, maka dapat diterima dalam menemukan  ilmu biologi Islam, penggunaan pancaindera yang sehat dan akal yang sehat untuk memahami kebenaran hakekat dari fenomena hayati organisme tumbuhan dan hewan/manusia yang hidup.

            Saintis/biologiwan mencari hakekat atau realitas dibalik alam fenomenal yang dlahir yang mampu merangkum berbagai performens hayati.  Akan tetapi  pencarian ilmu biologis kurang atau sedikit sekali menggunakan daya ilhami, karena ontologi biologi yang mensifatkan demikian, yang berbeda dengan sains sosial atau psikologi.  Fenomena biologi umumnya bersifat fisik yang mudah ditangkap oleh indera.  Oleh karena itu biologiwan sedikit mendapat penjelasan secara ilhami.   Meskipun demikian , dalam perjalanannya sering kita dengar berita dari para penemu sains terjadinya “lucky discovery”. Penemuan yang muncul tiba-tiba. Ilham/intuisi yang mengakhiri kemandegan saintis dalam pencarian ilmunya.

            Aristoteles 300 SM menyatakan pemikirannya, bahwa binatang mahluk kecil itu munculnya begitu saja dari benda yang mati.  Pemikiran itu dianut juga oleh Needham, pendeta  orang Irlandia yang pada tahun 1745-1750 mengadakan percobaan dan penelitian dengan variasi emulsi dan cairan biji-bijian, daging dan substrat lainnya.  Air rebusan yang disediakan disimpan rapat-rapat dalam wadah tertutup, namun mikroorganisme dapat muncul dan hidup pada media tersebut. Kesimpulannya, kehidupan baru dapat muncul dari benda yang mati.  Pendapat ini terkenal dengan teori abiogenesis (mahluk muncul begitu saja dari barang mati) atau juga disebut teori generatio spontanea (mahluk itu terjadi begitu saja muncul secara spontan).  Tetapi kemudian, pendapat Aristoteles dan Needhan tersebut dibantah oleh Spallanzani (1729-1799) yang membuktikan bahwa perebusan dan penutupan botol  yang dilakukan Needhan tidak akurat.

            Percobaan Schultze 1836 dan Schroeder dan Dusch pada 1854 serta Louis Pasteur  tahun 1865 membuktikan bahwa tidak ada kehidupan baru dari benda mati.  Pendapat ini dikenal dengan semboyan Omne vivum ex ovo, omne ovum ex vivo (kehidupan itu berasal dari telur, dan telur itu berasal dari sesuatu yang hidup).  Penelitian saintis barat tersebut belum dapat menjawab dari mana asal mahluk kecil (bakteri) bermula. Mereka berhenti disana, tidak ada panduan atau petunjuk yang mengarahkan pada suatu keyakinan yang berada di luar rasio mereka. 

Rasio mereka bergerak pada sesuatu yang tidak empiris.  Mereka mulai berpikir analisis-historis (sesuatu yang tidak dialami).  Mahluk hidup atau bakteri itu adalah entitas mikroorganisme yang wujudnya tersusun dari makro-molekul protein (daging), sedangkan protein tersusun dari molekul asam amino (NH₂).  Memang  rasional, elemen/unsur zat lemas atau nitrogen (N) dan hidrogen H₂ dan sulfida H₂S  berlimpah dialam ini.  Atmosfir (udara) bebas mengandung +78% gas nitrogen dan H₂ dapat terlisis dari air (H₂O), maka mereka menggunakan teori evolusi bahwa bakteri tersebut muncul melalui evolusi atau perubahan dari anasir yang ada di bumi yaitu dari zat nitrogen dan hidrogen.  Memang sekarang orang sudah dapat menyusun molekul protein sintetis dengan alat mesin yang sangat canggih, tetapi satu hal yang tidak dapat dibuat adalah “hidup”.  Bakteri adalah mahluk hidup yang dapat bergerak dan berbiak, bukan hanya molekul protein (daging) yang tidak bernyawa.

Hanyalah wahyu yang dapat menjawab pertanyaan dari mana dan bagaimana substansi protein itu menjadi hidup.  Al-Quran dalam surat al-Mu’minun ayat.14 memberikan panduan bagaimana fase-fase peristiwa (urutan-urutan) penciptaan makhluk (embriologi).  Pada fase akhir,  Allah menyatakan

 “…ﺭﺧﺁ ﺎﻗﻟﺨ ﻩﺎﻧﺄﺷﻧﺃ ﻢﺜ”.  Dengan ditiupkan roh ke dalam tubuhnya, maka jadilah makhluk.

Tugas saintis ahli embriologi untuk mengelaborasi fase-fase perkembangan embrio tersebut sehingga dikenali lebih jelas bagaimana agar embrio berkembang normal berdasarkan perhitungan kesehatan. Adapun permasalahan ruh pada mahluk hidup sulit dijelaskan, karena memang manusia hanya diberi sedikit ilmu tentang ruh itu  ( Al-Quran surat Bani Israil)

Wujud alam nyata ini relatif, yang wujudnya bergantung kepada tuhan,  menjadi ghayb bagi manusia karena dimensi jarak,  diisyaratkan dalam wahyu seperti yang tersurat dalah surat Ar-Rahman 33 :

...ﺍﻮﺫﻔﻧﺎﻔ ﺽﺭﻷﺍﻮ ﺕﺍﻮﻣﺳﻟﺍ ﺭﺎﻃﻗﺃ ﻦﻤ ﺍﻮﺫﻓﻧﺘ ﻥﺃ ﻢﺘﻌﻂﺗﺴ ﻥﺇ ﺲﻧﻹﺍﻭ ﻦﺠﻟﺍ ﺭﺸﻌﻣ ﺎﯿ  

Wujud yang jauh di sana, yang ghayb tidak tampak dengan mata menjadi objek kajian sains Islam

            Menjadi tidak tampak dengan mata telanjang , seperti wujud materi mikroorganisme (organisme super-mikroskopik : virus) yang dimensi besarnya hanya ukuran  mili mikron dan hanya dapat dilihat dengan bantuan mikroskop elektron yang memiliki magnifikasi >100.000 kali.  Organisme ini tidak tampak dengan mata telanjang karena sangat kecil dimensi wujudnya. Dalam surat al-Baqarah, wahyu Allah “...ﻰﯾﺤﺘﺴﯾ ﻻ ﷲﺍ ﻥﺇ” telah mengisyaratkat adanya wujud atau objek yang sangat kecil.

            Sering terjadi proses metabolisme kuratif yang diluar kendali rasio dan ilmu manusia.  Ketika diagnosis dokter atau analisis praktisi biologi menyimpulkan bahwa perkembangan fatogen/penyakit dalam organ tubuh mahluk tidak dapat dihentikan (penyakit tidak dapat disembuhkan), tetapi  Allah pencipta kehidupan menentukan lain.

Naquib Al-Attas dalam Adi Setia (2005 :57) menyebutkan bahwa akal atau intelek merupakan jembatan yang menghubungkan antara alam inderawi yang lebih rendah tahap wujudnya  dengan alam ruhani yang lebih tinggi tahap wujudnya serta yang menjadi sumber  kepada alam inderawi.  Melalui akal, manusia mampu mengalami tahap wujudi yang lebih tinggi itu.  Melalui akal juga manusia mampu memadukan aspek jasmaninya dengan aspek ruhaninya.  Dengan demikian manusia mampu mencapai pemahaman atau ilmu tentang fenomena dan naumena sekaligus.

Sebagai biologiwan Islam akan menyakini,  dibalik metabolisme hayati yang bekerja secara rasional yang relatif pasti itu, terdapat kepastian yang mutlak dari kekuasaan penggerak kehidupan. Setelah Allah menciptakan, Allah pun memeliharanya dan memberikan arahannya (ﻯﺪﻬﻔ ﺭﺪﻗ ﻯﺬﻠﺍ ﻭ , surat al-A’laa)

Biologiwan yang mengkaji sains empiris  atau alam hidup yang wujudnya tampak sekarang semakin mendekat ke arah pemikiran alam yang tidak tampak,  tetapi harus diyakini kewujudannya/eksistensinya, seperti wujud gelombang suara dan gelombang magnetik, wujud tenaga listrik.  Ilmu tersebut adalah ilmu empiris, tetapi hakekatnya melampaui alam yang tampak.  Kajian dalam mikrobiologi tanah, wujud fisik seonggok tanah,  tanah yang tampak pejal, masif, padat dan pasip tidak bergerak, akan terlihat oleh seorang mikrobiologiwan sebagai sebuah bangunan kandang peternakan yang lengkap dengan fasilitas untuk perkembangbiakan, sehingga suatu saat ia akan memanen ternaknya dengan memperoleh keuntungan yang berlimpah.  Biologiwan memandang tanah tersebut sebagai materi yang dinamis dan hidup.  Demikian juga saintis fisika, dalam kajian solid material (zat padat). Apa yang tampak kepadanya dari sebatang besi tidak sama dengan apa yang sedang terwujud di dalam rasionya.  Apabila batang besi itu dialiri arus listrik, maka akan terdapat wujud aliran listrik yang deras pada zat besi yang padat tersebut, dan jika  batang besi tersebut ditempelkan pada ujung/lidah api, maka akan terbayang molekul-molekul zat besi itu sedang bergerak (hakikat panas) seolah-oleh  wujud zat cair padahal dia sedang menghadapi sebatang besi yang padat dan sangat keras.

Epistemologis sains “empiris-ghoyb” tersebut akan mempengaruhi ontologi yang selama ini dianut oleh sains empiris logis.

            Nasim Butt (1996 : 72) mengatakan sedemikian terbatasnya kemampuan sainstis dalam mengobservasi dan mendeskripsi realita , kemampuan akal dan kapasitas pancainderanya terbatas, maka wahyu memandu dengan mengingatkan agar manusia sadar,  tidak terpesona dengan keberhasilan penemuan-penemuan sains dan hasil penelitian ilmiah.  Peringatan tersebut diantaranya pada ayat-ayat terakhir surat Yasin ayat 77-83.

Langkah penyusunan dan pencarian (enquiry) pengetahuan/ilmu hayat secara sistematis meliputi upaya observasi fenomena atau fakta empiris alami dan melalui pengamatan perlakuan (eksperimen). 

Observasi langsung di lapangan (in situ), pada beberapa kasus yang mungkin, dapat dilanjutkan dengan pengamatan di tempat dengan kondisi terkendali atau terkontrol  (in vitro ) melalui pekerjaan isolasi, dilanjutkan dengan pekerjaan  kultur/kultivasi  di habitat buatan. Contoh pengamatan terhadap mikroorganisme.

Langkah pengamatannya :

-1. Mikroorganisme yang dicurigai sebagai penyebab (penyakit/simtom atau gejala) akan selalu ada pada organisme yang sakit.

-2. Mikroorganisme tersebut  diambil dari tempat asal hidupnya (in situ) untuk ditumbuhkan/dilakukan piaraan dalam biakan murni.

-3. Jika mikroorganisme itu ditularkan kembali pada organisme (binatang yang sehat) harus menyebabkan sakit/gejala penyakit yang sama.

-4. Biakan yang sudah diisolasi harus dibuktikan bahwa penyakit disebabkan oleh mikroorganisme tersebut.

4.   Mikroorganisme yang diobservasi dapat diidentifikasi dan dideskripsi.

Langkah penelitian eksperimen biologi (sains alami yang relatif eksak)

1.Perumusan masalah : Permasalahan empiris (ayat kauniyah) atau isyarat ilmiah dari ayat Qauliyah.

2. Perumusan hipotesis : prediksi dan asumsi-asumsi.

3. Penyusunan perancangan penelitian (experiment design). Prosedur atau langkah dalam perancangan penelitian adalah sebagai berikut :

a. Perancangan perlakuan (treatment design). Faktor perlakuan yang akan diteliti dapat sederhana/tunggal atau faktorial/majemuk. Perlakuan faktorial dilakukan untuk efisiensi dan dapat mengamati pengaruh interaksi diantara berbagai level  perlakuan sekaligus.

b. Perancangan lingkungan (environmental design). Rancangan bergantung pada sifat dan jenis perlakuan. Perlakuan di laboratorium (lingkungan terkendali) atau di lapangan.

c. Rancangan respons.  Penentuan jenis dan jumlah variabel pengamatan /observasi.

d. Rancangan Analisis (statistika) dan pengujian hipotesis.

6. Ilmu yang Tidak Netral/Sarat Nilai

Kegunaan mempelajari ilmu hayat adalah agar dapat memahami fenomena,  gejala dan  fakta alam hayati dan menggunakan pemahaman itu untuk tindakan perbaikan dan upaya pelestarian alam hayati dan meningkatkan kesejahteraan manusia dan mahluk lainnya serta  untuk dapat memahami dan menyakini alam makhluk hidup sebagai ciptaan  Allah.  Klimaksnya manusia akan tunduk mengucapkan subhanallah  bahwa Allah menciptakan alam dan makhluk hidup itu secara terencana,  tertib dan tidak bathil.  Ilmu hayat sebagai ilmu yang menelaah  ayat-ayat kauniyah tidak bebas nilai (netral) tetapi sarat/penuh dengan nilai-nilai, dalam hal ini nilai islami.

            Bagaimana kegunaan dan pentingnya sains Islami dilaksanakan, Nasim Butt (1996) telah membuat perbandingan antara sains barat dan sains yang dipandu dengan ajaran Islam sebagai berikut :

Sains Barat	Sains Islam
1. Percaya pada rasionalitas.	1. Percaya pada wahyu
2. Sains untuk sains	2. Sains adalah sarana untuk mendapatkan ridlo Allah, bentuk ibadah spritual dan sosial.
3. Satu-satunya metode untuk mengetahui realitas	3.Banyak cara berlandaskan akal dan wahyu untuk mengetahui realitas
.4. Netralitas emosional sebagai prasyarat  menggapai rasionalitas	.4. komitmen emosional sangat penting untuk mengangkat usaha-usaha sains spiritual maupun sosial.
5. Tidak memihak, ilmuwan harus peduli hanya pada produk pengetahuan baru dan akibat penggunaannya	5. Pemihakan pada kebenaran, yaitu apabila sains merupakan salah satu bentuk ibadah, maka seorang ilmuwan harus peduli pada akibat-akibat penemuannya sebagaimana terhadap hasilnya, maka harus baik secara moral dan mencegai ilmuwan agar tidak jadi agen tidak bermoral.
6. Tidak ada bias, vaditas pernyataan sains hanya bergantung pada bukti penerapannya dan bukan pada ilmuwan yang menjalankannya.	6. Adanya subjektivitas. Arah sains dibentuk oleh kriteria subjektif, validitas  sebuah pernyataan sains bergantung baik pada bukti-bukti pelaksanaannya maupun pada tujuan dan pandangan orang
7. Penggantungan pendapat, pernyataan sains hanya dibuat atas dasar bukti yang menyakinkan.	7. menguji pendapat, pernyataan sains selalu dibuat atas dasar bukti yang tidak menyakinkan, ketika bukti  yang menyakinkan dikumpulkan biasanya terlambat.
8. Reduksionisme, cara dominan untuk mencapai kemajuan sains.	8. Sintesis, cara doninan meningkatkan kemajuan sains, termasuk sintesis sains dan nilai-nilai.
9. Fragmentasi, sains adalah sebuah aktivitas yang rumit, maka harus dibagi ke dalam disiplin-disiplin dan subdisiplin	9. Holistik, pemahaman interdisipliner
10. Universalisme, meskipun sains itu universal, namun buahnya hanya untuk mereka yang mampu membelinya. Dengan demikian bersifat memihak	10, Universalisme, buah sains adalah untuk seluruh ummat manusia, ilmu pengetahuan , kebijaksanaantidak dapat diukur atau dijual
11. Individualisme yang menyakini bahwa ilmuwan harus menjaga jarak dengan permasalahan sosial, politik dan ideologis.	11. Orientasi masyarakat, Pencarian sains adalah kewajiban masyarakat
12. Netralitas, sains adalah netral, baik atau buruk.	12. Orientasi nilai, sebagai mana aktivitas manusia yang sarat nilai.  Sains yang menjadi benih perang adalah jahat.
13. Loyalitas kelompok, hasil pengetahuan baru melalui penelitian adalah aktivitas penting dan pelu dijungjung tinggi.	13. Loyalitas pada tuhan dan makhluknya. Hasil pengetahuan baru adalah cara memahami ayat-ayat Allah.
14. Kebebasan absolut, setiap pengekangan atau penguasaan penelitian sains harus dilawan	14. Manajemen sains merupakan sumber yang tidak ternilai, harus digunakan untuk kebaikan
15. Tujuan memebenarkan sarana, karena penelitian ilmiah adalah mulia dan penting bagi kesejahteraan ummat manusia, maka setiap sarana termasuk manfaat hewan hidup, kehidupan manusia, dan janin dibenarkan untuk sarana penelitian.	15 Tujuan tidak membenarkan sarana, tidak ada perbedaan antara tujuan dan sarana, keduanya harus halal yakni memenuhi batas-batas etika dan moral.

           

Demikian idealnya moralitas sains yang dipandu wahyu ,  sebagai contoh  metode percobaan untuk menentukan efikasi (kemujaraban) konsentrasi atau dosis  zat kimia pestisida yang diukur dengan satuan LD₅₀ (lethal dosage) perlu dilakukan untuk mengendalikan efek pengrusakan yang liar (drift effect).  Apabila suatu populasi spesies dapat mati dengan pestisida yang berkatagori LD₅₀ rendah (angka LD₅₀ lebih besar), maka tidak bijaksana jika digunakan pestisida  berkatagori LD₅₀ tinggi.

            Tantangan globalisasi dan kecanggihan informatika serta teknik komunikasi telah memalingkan arah para pengelola ilmu.  Ilmu dianggap komoditi yang harus diperjualbelikan.  Dampaknya Universitas tertarik pada pelayanan program studi yang mudah dijual, sehingga konsep ilmu berubah dari mengenal kholiq menjadi fokus pada kemahiran.  Universitas berubah menjadi pabrik penghasil tenaga kerja, bukan menjadi pusat perkecambahan ide-ide murni dan besar.

            Dengan demikian, UIN/IAIN/STAIN tidak boleh latah terbawa arus meterialistis dan berpikir fragmatis sesaat, tetapi sebagai perguruan tinggi islam yang dibangun untuk mencari keridlaan Allah harus menyongsong ide-ide  suci dan besar yaitu menjadi pesemaian ilmuwan pemikir dan pencetus ide pembangun ummat, pengawal tauhid., menjadi universitas yang melahirkan benih-benih penemu dan penggali sumber kehidupan hakiki bukan semata pencetak pekerja.    Wallahu a’lam.

* DR. Ir. M. Subandi, Drs.,MP

Dekan Fakultas Sains dan Teknologi

Doktor Ilmu Pertanian alumnus Univ. Padjadjaran

Pustaka :

-Adi Setia.  2005.  Epistemologi Islam Menurut Al-Attas. Satu Uraian Singkat.  Islamia. Thn II. No 6. 2005. Jakarta   h. 53-58

- Nasim Butt. 1996. Sains dan Masyarakat Islam. Pustaka Hidayah.  Bandung

-Rustam Effendi. 2003. Produksi Dalam Islam. Magistra Insani Press. MSI UII Yogyakarta.

sejarah dan ruang lingkup mikrobioloi

SEJARAH DAN RUANG LINGKUP MIKROBIOLOGI

Ringkasan

Pokok bahasan ini akan memperkenalkan bidang mikrobiologi dan membahas kepentingan mikroorganisme tidak hanya sebagai agen penyakit tetapi juga sebagai penyokong produksi makanan, pabrik antibiotik, pengembangan vaksin, dan pengelolaan lingkungan. Pokok bahasan ini juga akan menyajikan sejarah singkat ilmu mikrobiologi, kilasan dunia mikroba, diskusi ruang lingkup dan relenasi mikrobiologi dalam masyarakat sekarang ini, dan prediksi masa depan mikrobiologi.

Kompetensi

Setelah membaca pokok bahasan ini Saudara diharapkan dapat::

1. mendefinisikan ilmu mikrobiologi dan menguraikan beberapa metode umum yang digunakan dalam mempelajari mikroorganisme.
2. menjelaskan konsep historis generasi spontan dan percobaan-percobaan yang dilakukan untuk mematahkan konsep generasi spontan
3. menjelaskan bagaimana postulan Koch digunakan untuk menjelaskan hubungan sebab akibat antara agen (suspected) mikroba  dan penyakit,  
4. menguraikan beberapa ragam aktivitas mikroorganisme yang menguntungkan manusia,
5. menguraikan morfologi prokariotik dan eukariotik, dua tipe anatopi seluler, dan juga pengelompokan mikroorganisme dalam kingdom or domain,
6. menjelaskan sumbangan penting bidang mikrobiologi dalam bidang biologi yang lain dan kesejahteraan manusia.

Konsep-konsep penting yang dipelajari dalam pokok bahasan ini meliputi:

1. Mikrobiologi adalah kajian organisme yang sangat kecil untuk dapat dilihat dengan mata telanjang
2. Perkembangan mikrobiologi sebagai disiplin ilmu tergantung pada ketersediaan mikroskop dan kemampuan untuk mengisolasi dan menumbuhkan kultur murni mikroorganisme..
3. Banyak penyakit disebabkan oleh infeksi virus, bakteri, jamur, dan protozoa
4. Postulat Koch digunakan untuk menjelaskan hubungan sebab akibat antara mikroorganisme dan penyakit
5. Mikroorganisme tidak timbul secara spontan tetapi berasal dari mikroorganisme lain..
6. Mikroorganisme mempunyai satu dari dua tipe sel dasar yaitu prokariotik dan eukariotik.
7. Microorganisms are responsible for many of the changes observed in organic and inorganic matter, such as fermentation.

Garis besar pokok bahasan

1. Mikrobiologi - Pendahuluan
1. Mikrobiologi adalah kajian organisme yang terlalu kecil untuk dapat dilihat dengan jelas menggunakan mata telanjang; kajian ini mencakup virus, bakteri, archaea, protozoa, algae, dan jamur
2. Beberapa mikroba (seperti algae dan jamur) cukup besar untuk dapat dilihat dengan mata telanjang, namun kedua organisme masih dimasukkan dalam kajian mikrobiologi, hal ini karena teknik yang digunakan untuk mengkajinya (seperti isolasi, sterilisasi, kultivasi dalam media artifisial) sama seperti anggota mikroorganisme lainnya.
2. Penemuan Mikroorganisme
1. Mahluk hidup yang tidak dapat dilihat diduga ada dan dianggap sebagai penyebab penyakit jauh sebelum mahluk hidup tersebut bisa diamati.
2. Antony van Leeuwenhoek (1632-1723) mengkonstruksi mikroskop dan orang pertama yang mengamati dan mendeskripsikan mikroorganisme secara akurat.
3. Konflik tentang  Generasi Spontan
1. Usulan konsep generasi spontan meyakini bahwa organisme hidup dapat berkembang dari materi tidak hidup atau dekomposisi.
2. Francesco Redi (1626-1697) membantah konsep generasi spontan dengan menunjukkan bahwa belatung pada daging busuk berasal dari telur lalat yang meletakkan telur pada daging tersebut, bukan dari daging itu sendiri..
3. John Needham (1713-1781) mendukung teori generasi spontan dengan menunjukkan bahwa kaldu yang dipanaskan dalam labu dan kemudian ditutup masih dapat memunculkan mikroorganisme.
4. Lazzaro Spallanzani (1729-1799) menunjukkan bahwa labu yang ditutup dan kemudian dididihkan tidak ada mikroorganisme yang tumbuh, dan menyatakan bahwa udara yang masuk ke labu medium membawa benih, dan udara mungkin diperlukan untuk mendukung pertumbuhan organisme yang sudah ada di medium.
5. Louis Pasteur (1822-1895) menjebak organisme yang terbawa udara dalam kapas, dia juga memanaskan leher labu angsa, mensteril meida, membiarkan labu terbuka; hasil percobaan menunjukkan tidak ada pertumbuhan organisme sebab partikel debu yang membawa organisme tidak mencapai medium; namun debu terjebak dalam leher labu; jika leher labu dipecah, debu akan mencapai medium dan organisme akan tumbuh; dengan cara ini, Pasteur telah mematahkan teori generasi spontan.
6. John Tyndall (1820-1893) menunjukkan bahwa debu membawa mikroba dan jika debu tidak ada, medium tetap steril, bahkan jika medium terdedah udara. Tydall juga memberikan bukti keberadaan bakteri yang resisten panas.
4. Mikroorganisme sebagai agen penyakit
1. Pengenalan hubungan antara mikroorganisme dan penyakit
1. Agostino Bassi (1773-1856) menunjukkan bahwa penyakit ulat sutra disebabkan jamur
2. M. J. Berkeley (± 1845) menunjukkan bahwa penyakit kentang (the Great Potato Blight) Irlandian disebabkan oleh jamur.
3. Louis Pasteur menunjukkan bahwa penyakit (péine) ulat sutra disebabkan oleh parasit protozoa.
4. Joseph Lister (1872-1912) menunjukkan suatu sistem pembedahan yang dirancang untuk mencegah mikroorganisme menginfeksi luka bedah, sehingga pasiensi jauh lebih sedikit yang terinfeksi pascaoperasi;  Lister memberikan bukti tidak langsung bahwa mikroorganisme adalah agen penyebab penyakit manusia.
5. Robert Koch (1843-1910), yang menggunakan kritetia yang dikembangkan oleh gurunya, Jacob Henle (1809-1895), dapat menjelaskan hubungan antara Bacillus anthracis and anthrax; kriterianya dikenal sebagai postulat Koch dan masih digunakan untuk menjelaskan hubungan antara mikroorganisme tertentu dengan penyakit tertentu.:
1. Mikroorganisme harus ada di setiap kasus penyakit tetapi tidak ada pada individu sehat
2. Mikroorganisme yang dicurigai (suspected) harus dapat diisolasi dan ditumbuhkan dalam kultur murni
3. Penyakit yang sama harus timbul jika mikroorganisme hasil isolasi diinokulasi tersebut pada individu sehat.
4. Mikroorganisme yang sama harus ditemukan lagi dari individu yang sakit tersebut
6. Kerja Koch dikorfirmasi secara independen oleh Pasteur.
2. Perkembangan teknik untuk mempelajari patogen-patogen (mikroba)
1. Koch dan kawan-kawan mengembangkan teknik, reagen, dan materi lain untuk mengkultur patogen bakteri pada media padat pertumbuhan, dengan demikian mikrobiologis dapat mengisolasi mikroba untuk mendapatkan kultur murni (tunggal).
2. Charles Chamberland (1851-1908) membuat filter (saringan) bakteri untuk menapis bakteri dan mikroba yang lebih besar dari spesimen; melalui teknik ini juga memungkinkan ditemukannya virus sebagai agen penyebab penyakit.
3. Kajian Imunologis
1. Edward Jenner (±1798) menggunakan prosedur vaksinasi untuk melindungi individu dari penyakit cacar (smallpox)
2. Louis Pasteur mengembangkan vaksin lain untuk penyakit kolera ayam, antraks, dan rabies.
3. Emil von Behring (1854-1917) and Shibasaburo Kitasato (1852-1931) menginduksi pembentuk antitoksin toksin diptera pada kelinci; antitoksin digunakan secara efektif untuk mengobati manusia dan memberikan bukti imunitas humoral.
4. Elie Metchnikoff (1845-1916) menunjukkan keberadaan sel fagositik dalam darah, yang menunjukkan imunitas dimediasi sel
5. Industrial Microbiology and Microbial Ecology
1. Louis Pasteur menunjukkan bahwa fermentasi adalah hasil aktivitas mikroba, pada beberapa organisme dapat menurunkan hasil alkohol, dan beberapa fermentasi adalah aerobik dan aerobik; Pasteur juga mengembangkan proses pasteurisasi untuk mengawetkan anggur selama penyimpanan.
2. Sergei Winogradsky (1856-1953) yang bekerja dengan bakteri tanah menemukan bahwa bakteri tanah dapat oksidasi besi, belerang, dan amonia untuk mendapatkan energi; Winogradsky juga mengkaji fiksasi nitrogen anaerobik dan dekomposisi selulosa.
3. Martinus Beijerinck (1851-1931) mengisolasi bakteri pengikat nitrogen aerobik, suatu bakteri bintil akar yang mampu menambat nitrogen, and bakteri pereduksi sulfat.
4. Beijerinck and Winogradsky memperkenalkan pertama kali penggunaan kultur yang diperkaya dan media selektif.
6. Anggota Dunia Mikroba
1. Prokariot mempunyai morfologi relatif sederhana dan tidak mempunyai membran nukleus
2. Eukariot mempunyai morfologi kompleks dan membran nukleus
3. Pada skema klasifikasi digunakan yang secara umum, organisme dibagi menjadi lima kingdom: Monera atau Prokarot, Protista, Fungi, Hewan dan Tumbuhan; Kajian ahli mikrobiologi terutama pada anggota tiga kingdom pertama dan juga virus, yang tidak diklasifikasi sebagai organisme hidup.
4. Sekarang ini, skema klasifikasi yang terdiri dari tiga domain (Bakteri, Archaea, dan Eukaria) telah diterima secara luas.
7. Cakupan dan Relevansi Mikrobiologi
1. Mikroorganisme adalah organisme hidup yang pertama kali di planet bumi, hidup di mana pun selama kehidupan memungkinkan, lebih banyak dibandingkan organisme lain, dan mungkin penyusun terbesar komponen biomasa bumi
2. Seluruh ekosistem tergantung pada aktivitas mikroorganisme, dan mikroorganisme mempengaruhi masyarakat manusia
3. Mikrobiologi mempunyai imbas terhadap banyak bidang di antaranya kedokteran, pertanian, ilmu pangan, ekologi, genetika, biokimia, dan biologi molekuler.
4. Mikrobiologiwan dapat mendalami tipe organisme spesifik:
1. Virologiwan-viruses
2. Bacteriologiwan-bacteria
3. Phycologiwan atau Algologiwan-algae
4. Mykologiwan-Jamur
5. Protozoologi-protozoa
5. Mikrobiologiwan mungkin tertarik pada berbagai karakter dan aktivitas mikroorganisme::
1. Morfologi Mikroba
2. Sitologi Mikroba
3. Fisiologi Mikroba
4. Ekologi Mikroba
5. Genetika dan Biologi Molekuler Mikroba  
6. Taksonomi Mikroba
6. Mikrobiologiwan dapat mengfokuskan pada aplikasi mikroorganisme::
1. Mikrobiologi Kedokteran, termasuk imunologi
2. Mikrobiologi Pangan
3. Mikrobiologi Kesehatan Masyarakat
4. Mikrobiologi Pertanian
5. Mikrobiologi Industri
8. Mikrobiologi di Masa Depan
1. Mikrobiologi telah dan akan terus berpengaruh terhadap masyarakat.
2. Ahli mikrobiologi di masa depan akan::
1. Mencoba untuk memahami secara lebih baik dan mengendalikan penyakit yang telah ada, yang muncul, dan muncul kembali.
2. Mengkaji ketekaitan antara agen infeksi dengan penyakit kronis.
3. Mempelajari lebih mendalam tentang pertahanan inang dan interaksi inang-patogen.
4. Mengembangkan aplikasi baru mikroba dalam bidang industri, pertanian, dan pengendalian lingkungan
5. Masih mengungkap banyak mikroba yang belum dapat diidentifikasi dan dikultivasi
6. Mencoba memahami secara lebih baik bagaimana mikroba berinteraksi dan berkomunikasi
7. Menganalisis dan menafsirkan data yang terus meningkat dari kajian genom
8. Melanjutkan penggunaan mikroba sebagai sistem model untuk menjawab pernyataan fundamental dalam bidang biologi
9. Memperkirakan dan mengkomunikasikan dampak potensial penemuan dan teknologi baru terhadap masyarakat.

Situs Internet yang berkaitan

Stalking the Mysterious Microbe!(also in Spanish) (http://www.microbe.org/)

Antony van Leeuwenhoek (1632-1723) (http://www.ucmp.berkeley.edu/history/leeuwenhoek.html)

American Society for Microbiology (http://www.asmusa.org/) Home Page

Microbiology, Bugs in the News! (http://falcon.cc.ukans.edu/~jbrown/bugs.html) "Read about cryptosporidium, AIDS and HIV, flu, E. coli, the immune system and lots more".

Microbiology (http://www.suite101.com/welcome.cfm/microbiology) by Neal Rolfe Chamberlain - weekly microbiology articles

Bug Bytes (http://people.ku.edu/~jbrown/bugs.html)

Exploring Microbiology as a Career (http://www.asmusa.org/edusrc/edu9.htm)

Posisi fungi dalam taksonomi

Posisi fungi dalam taksonomi

Fungi dulu dikelompokkan sebagai tumbuhan. Dalam perkembangannya, fungi dipisahkan dari tumbuhan karena banyak hal yang berbeda. Fungi bukan autotrof seperti tumbuhan melainkan heterotrof sehingga lebih dekat ke hewan. Usaha menyatukan fungi dengan hewan pada golongan yang sama juga gagal karena fungi mencerna makanannya di luar tubuh (eksternal), tidak seperti hewan yang mencerna secara internal. Selain itu, sel-sel fungi berdinding sel yang tersusun dari kitin, tidak seperti sel hewan.

Cara hidup

Fungi hidup menyerap zat organik dari lingkunganya. Berdasarkan cara memperoleh makannya, fungi mempunyai sifat sebagai berikut:

·                     Saprofit

·                     Parasit

·                     Mutual

dan lain - lain

Habitat

Fungi hidup pada lingkungan yang beragam namun sebagian besar jamur hidup di tempat yang lembab. Habitat fungi berada di darat (terestrial) dan di tempat lembab. Meskipun demikian banyak pula fungi yang hidup pada organisme atau sisa-sisa organisme di laut atau di air tawar. Jamur juga dapat hidup di lingkungan yang asam.

Reproduksi

Fungi melakukan reproduksi secara aseksual dan seksual. Reproduksi secara aseksual terjadi dengan pembentukan kuncup atau tunas pada jamur uniselule serta pemutusan benang hifa (fragmentasi miselium) dan pembentukan spora aseksual (spora vegetatif) pada fungi multiseluler. Reproduksi jamur secara seksual dilakukan oleh spora seksual. Spora seksual dihasilkan secara singami. Singgami terdiri dari dua tahap, yaitu tahap plasmogami dan tahap kariogami.

Klasifikasi

Fungi diklasifikasikan menjadi 6 klasifilasi:

·                     Zygomycota

·                     Acsomycota

·                     Basidiomycota

·                     Deuteromycota

·                     Mikoriza

·                     Lumut Kerak

Klasifikasi Jamur

Klasifikasi Jamur

jamur di bagi menjadi 6 divisi antara lain : Oomycotina, Zygomycotina, Ascomycotina, Basidiomycotina, dan Deutromycotina.

1. Oomycotina

Hifa pada jamur ini bersifat senositik, yaitu tidak bersekat-sekat sehingga inti sel banyak tersebar di dalam protoplasma. Dinding selnya tersusun atas selulosa, hal inilah yang membedakan dengan golongan jamur lainnya.

Pertumbuhan hifa jamur terjadi pada bagian ujungnya yang menghasilkan beberapa percabangan. Pada akhir ujung percabangan itu terbentuk gelembung sporangium yang dipisahkan oleh sekat. Hal ini merupakan awal perkembangbiakan jamur secara tidak kawin (aseksual).

Dalam sporangium terdapat protoplasma yang banyak mengandung inti sel. Protoplasma akan terbagi-bagi dan setiap bagian memperoleh satu inti sel yang berkembang menjadi spora dengan dua flagel sebagai alat geraknya. Spora yang mempunyai flagel disebut zoospora yang merupakan ciri khas Oomycotina. Selanjutnya, zoospora akan keluar dari sporangium kemudian melepaskan flagelnya sambil membentuk dinding selulosa. Jika zoospora ini sampai di tempat yang sesuai, maka akan menjadi tumbuh hifa baru.

Ciri-ciri jamur yang termasuk golongan Oomycotina adalah sebagai berikut.

a.                   Hifa tidak bersekat.

b.                  Reproduksi aseksual dengan zoospora yang mempunyai dua flagel.

c.                   Reroduksi seksual dengan bersatunya gamet betina dan gamet jantan membentuk oospora (sel telur yang telah dibuahi membentuk dinding yang tebal) kemudian memasuki periode istirahat.

Jenis jamur yang termasuk Oomycotina adalah Saprolegnia sp, Phytophtora sp, dan Phytium sp.

a. Saprolegnia sp

Jamur ini umumnya hidup saprofit. Miseliumnya berkembang di dalam substrat, sedangkan yang terlihat di luar substrat berfungsi untuk perkembangbiakan. Jika Anda amati jamur ini dengan mikroskop, di bagian ujung miseliumnya akan tampak sporangium yang menghasilkan zoospora.

Saprolegnia sp yang hidup saprofit mudah dikembang-biakkan dengan meletakkan serangga mati atau biji kacang tanah pada cawan berisi air kolam. Hifa yang baru tumbuh akan menembus tubuh serangga atau biji kacang tanah untuk mendapatkan makanan. Sebagian hifa lainnya akan tumbuh keluar membentuk sporangium penghasil zoospora, sedangkan oogonium dan anteridiumnya berperan pada perkembangbiakan seksual.

Contoh jamur dari Oomycotina lainnya adalah Achlya sp yang hidup saprofit seperti Saprolegnia sp.; Plasmopora sp hidup parasit pada tanaman anggur; serta Sclerospora maydis penyebab penyakit bulai pada jagung seperti pada gambar 1 berikut ini

Gambar 1. Sclerospora maydis

b. Phytophtora sp

Contoh jamur dari golongan Oomycotina ini antara lain: Phytophtora infestans yang hidup parasit pada tanaman kentang.

Pada jamur ini, ujung-ujung hifa tidak membentuk zoosporangium melainkan membentuk konidium. Konidium adalah spora yang dibentuk secara aseksual dan terjadi akibat diferensiasi dari ujung hifa. Ujung hifa menyembul di permukaan daun kentang melalui stoma (mulut daun) yang terkena infeksi. Untuk lebih jelasnya dapat dipelajari pada gambar 2 berikut ini.

Gambar 2. Ujung hifa Phytophtora infestans menembus stoma daun kentang

Phytophtora sp tidak hanya menyebabkan penyakit pada tanaman kentang, melainkan dapat pula menyebabkan penyakit pada buah cokelat, tanaman lada, kina, kelapa, cengkeh, tem-bakau, dan jarak.

c. Pythium sp

Phytium sp hidup saprofit di tanah lembab, tetapi zoospora yang dihasilkannya melalui perkembangbiakan aseksual sedangkan oospora melalui perkembangbiakan seksual. Jamur ini dapat menginfeksi tanaman seperti pada persemaian tem-bakau yang dikenal dengan penyakit patah rebah semai. Jamur ini juga dapat menyebabkan penyakit busuk pada kecambah tembakau, kina, bayam, jahe, nenas, dan kemiri.

2. Zygomycotina

Jamur ini hidup sebagai saprofit atau parasit. Sebagai jamur parasit dapat menyebabkan pembusukan tanaman ubi jalar dan buah arbei, sedangkan sebagai jamur saprofit dapat hidup pada roti, nasi, dan wortel. Perlu diketahui bahwa jamur saprofit ini sangat bermanfaat dalam fermentasi pembuatan tempe.

Hifa yang menyusun jamur ini bersifat senositik (tidak bersekat-sekat sehingga inti sel banyak tersebar di dalam protoplasma), sedangkan dinding selnya tersusun dari kitin (sejenis karbohidrat mengandung nitrogen).

Contoh jenis jamur Zygomycotina yang mudah diperoleh adalah jamur tempe dan jamur roti. Hifa kedua jenis jamur ini pendek bercabang-cabang dan berfungsi sebagai akar (rizoid) untuk melekatkan diri serta menyerap zat-zat yang diperlukan dari substrat. Selain itu, terdapat pula sporangiofor (hifa yang mencuat ke udara dan mengandung banyak inti sel, di bagian ujungnya terbentuk sporangium (sebagai penghasil spora), serta terdapat stolon (hifa yang berdiameter lebih besar daripada rizoid dan sporangiofor).

Jenis jamur yang termasuk Zygomycotina adalah Rhizopus stolonifer yang dapat diamati dengan menggunakan mikroskop seperti pada gambar 3 berikut ini.

Gambar 3. Rhizopus stolonifer

3. Ascomycotina

Sebagian besar dari jamur yang termasuk golongan Ascomycotina mempunyai hifa bersekat-sekat dan bercabang-cabang. Selain itu, terdapat jenis jamur yang mempunyai hifa berlubang sehingga protopolasma dan inti sel dapat mengalir dari satu sel ke sel lainnya. Struktur tubuh jamur dari golongan Ascomycotina ada yang multiseluler atau uniseluler seperti pada ragi.

Ascomycotina merupakan kelompok jamur yang terbesar, ada yang hidup parasit atau saprofit. Jamur yang hidup sebagai parasit, dapat menimbulkan penyakit yang sangat merugikan seperti pada tanaman tembakau, pepaya, karet, teh, cokelat, dan padi. Sedangkan jamur saprofit hidup pada bahan makanan atau sampah.

Beberapa jenis jamur Ascomycotina yang bermanfaat bagi manusia adalah Saccharomyces sp, Penicillium sp, Aspergillus sp dan Neurospora sp.

a. Saccharomyces sp

Ciri umum Saccharomyces sp (ragi) tidak mempunyai hifa dan tubuh buah. Jenis ragi yang dimanfaatkan untuk pem-buatan tape atau pengembang adonan roti adalah Saccharo-myces cerevisiae. Jamur ini dapat memfermentasi glukosa menjadi alkohol dan karbon dioksida. Reaksi kimianya adalah sebagai berikut.

C6H12O6 --> 2C2H5OH + 2CO2 + energi

(gkukosa) (alkohol)

Saccharomyces cerevisiae sebagai pengembang roti atau kue akan berhenti tumbuh jika kadar alkohol mencapai 4-5%, sedangkan CO2 yang dihasilkan akan mengembangkan adonan roti. Alkohol akan menguap habis ketika roti dibakar. Saccharomyces cerevisiae yang dimanfaatkan dalam minuman beralkohol baru berhenti tumbuh (berkembang biak) pada kadar alkohol mencapai 14-17%.

b. Penicillium sp

Jamur ini tumbuh di mana-mana dan tampak tumbuh sebagai noda hijau atau biru pada buah-buahan ranum atau penganan yang bergula. Selain itu, jamur ini dapat tumbuh baik pada roti dan nasi. Oleh karena itu, jika menyimpan roti dan nasi di tempat yang agak lembab, maka akan ditumbuhi jamur Penicillium sp. dengan konidia yang berwarna kehijauan.

ungi adalah nama regnum dari sekelompok besar makhluk hidup eukariotik heterotrof yang mencerna makanannya di luar tubuh lalu menyerap molekul nutrisi ke dalam sel-selnya. Fungi memiliki bermacam-macam bentuk. Awam mengenal sebagian besar anggota Fungi sebagai jamur, kapang, khamir, atau ragi, meskipun seringkali yang dimaksud adalah penampilan luar yang tampak, bukan spesiesnya sendiri. Kesulitan dalam mengenal fungi sedikit banyak disebabkan adanya pergiliran keturunan yang memiliki penampilan yang sama sekali berbeda (ingat metamorfosis pada serangga atau katak). Fungi memperbanyak diri secara seksual dan aseksual. Perbanyakan seksual dengan cara :dua hifa dari jamur berbeda melebur lalu membentuk zigot lalu zigot tumbuh menjadi tubuh buah, sedangkan perbanyakan aseksual dengan cara membentuk spora, bertunas atau fragmentasi hifa. Jamur memiliki kotak spora yang disebut sporangium. Di dalam sporangium terdapat spora. Contoh jamur yang membentuk spora adalah Rhizopus. Contoh jamur yang membentuk tunas adalah Saccharomyces. Hifa jamur dapat terpurus dan setiap fragmen dapat tumbuh menjadi tubuh buah. Ilmu yang mempelajari fungi disebut mikologi (dari akar kata Yunani μυκες, "lendir", dan λογοσ, "pengetahuan", "lambang").